A duración da edición de xenes pola tecnoloxía tradicional é na súa maioría inferior a 5 kb, e canto máis longo sexa o fragmento editado menor será a taxa de éxito.Ademais, para construír un modelo de rato knock-in/knock-out de fragmentos longos utilizando técnicas tradicionais, os ratos quiméricos deben ser criados e examinados durante 2-3 xeracións para obter os ratos obxectivo, e todo o proceso leva máis de 10- 12 meses.
As vantaxes da edición xenética de fragmentos longos residen na súa capacidade para superar certas limitacións dos métodos tradicionais de edición de xenes.